قسم أمراض الجهاز الهضمي بمستشفى فريد حبيب يقدم مجموعة كاملة من خدمات علاج أمراض الجهاز الهضمي، البنكرياس، القنوات المرارية، والكبد لمرضى الأقسام الداخلية ومرضى العيادات الخارجية. يتوفر بالقسم أيضا″ الخدمات التشخيصية من مناظير الجهاز الهضمي والفحوص الاخرى اللازمة. خدمات مناظير الطوارئ متوفرة على مدار الساعة (24/7).